临床检验诊断学系（简称检验学系）在2014年正式成立。作为一支年轻的教学团队，检验学系在摸索中不断前行。目前学系设立学系主任（徐英春）1名，副主任（邱玲、陈曦、齐军）3名，教研室组长（张时民、刘中娟、程歆琦、孙宏莉、周洲）5名，教学秘书（杨卓、张睿、刘亚丽）3名，授课教师59名。按照临床检验诊断学系建设和发展的需要，学系初步开设临床血液和体液学检验教研室、临床生物化学检验教研室、临床微生物检验教研室、临床免疫学检验教研室、临床分子生物学教研室、临床实验室质量管理教研室共6个教研室，每个教研室聘任教研室组长一名。此外，检验学系已不仅仅局限于北京协和医学院八年制教学和专升本教学，也将住院医师、进修生、实习生、研究生、继续教育学习和各种国内外培训等领域纳入到了检验学系管辖的范畴，并由学系统一管理和协调。在短短两年的时间内，检验学系已从多个领域实现了零的突破。如首次组建学系组织结构图、制定学系年度预算明细及细则说明、制定学系教学考评细则、制定教师竞聘上岗的条件及流程、制定学系拟聘外籍教授的标准及管理办法、统一管理研究生答辩及相关事宜。除此之外，学系正在筹备精品教学视频课程，进而为更多师生提供网络自主学习平台。

复旦大学医院管理研究所发布2016年度最佳医院及专业排行榜，该学科检验医学排名第二；2014年以来，学系申请并获批教学改革项目两项；科研基金项目申请并获批14项，其中国家级6项，市级4项，院校级4项；申请并获批专利3项；学系开展继续继续教育项目共14项，参会人数共计4514人；学系教学人员参加百人计划培训4人，CTSI“临床研究设计”2人，国内外培训及交流188人次；发表科研文章184篇，其中SCI 79篇，中文核心105篇；学系获校级优秀教学团队1次，校级优秀教师1次，院级优秀教师2次，青年教师基本功比赛三等奖1次。