北京协和医院普通外科专业在我国医学史上有着辉煌的业绩，涌现出很多全国甚至国际闻名的医学专家，比如曾宪九、朱预、费立民、蒋朱明、钟守先、赵玉沛教授等。基本外科成立于1921年，是与我院院龄相同的核心科室之一。80年代初，著名外科学家曾宪九教授根据学科特点，在国内最早建立专业组：包括胰腺、胃肠、乳腺、肝胆、外科营养、重症（ICU）及相关临床专业实验室；在朱预、赵玉沛、邱辉忠教授等主导下，逐步完善成立亚专科。2012年成为国家临床重点专科，不断完善现有制度，各专业均衡发展。经过几十年几代人的不懈努力，现拥有300张病床及2个分子生物学实验室，已成为普外领域全国疑难重症疾病的诊治中心。2009年-2021年，在复旦大学医院管理研究所发布的中国最佳专科声誉排行榜中，基本外科连续十三年在全国排名第一。

北京协和医院普通外科专业具有丰富的病例资源，年住院病人数超过30000例次，门诊量超过30万人次，手术量近16000台次，在胰腺疾病、胃肠疾病、肝胆疾病、肠外肠内营养等临床与科研领域独具特色，部分研究处于国内、国际领先水平，如胰腺癌的早期诊断、综合治疗，胰腺内外分泌肿瘤的诊治，胰腺疾病微创技术应用，胰腺疾病基因研究，胃肠道良恶性肿瘤的早期诊断、综合治疗，胃癌、结直肠癌微创技术应用，胆道疾病的诊治及微创技术应用，外科肠内外营养，甲状腺疾病诊治等领域。依托北京协和医院强大的多学科优势，2008年首先在国内开展胰腺疑难病多学科诊疗模式，并向全国推广；其后形成了很多具有协和特色的诊疗技术：如胆道疾病会诊MDT、肥胖症外科治疗MDT、结直肠肿瘤MDT、炎性肠病MDT等。基本外科的手术技术一直居于国内领先地位，1951年曾宪九教授开展了我国首例胰十二指肠切除术；自上世纪90年代在国内率先开展腔镜手术以来，目前科室90%以上术式均采用腔镜微创手术，机器人手术完成一千余例；科室重视疑难复杂手术患者的收治，四级手术占比长年维持在80%左右。目前是国家临床重点专科及北京市重点学科，是中华医学会会长及外科学分会主任委员单位，科室较多专家在国内各学术团体担任主委、组长等重要职位。

北京协和医院普通外科专业作为北京市重点学科、国家重点（培育）学科和首批国家普通外科学专科医师规范化培训试点基地，具有良好的教学传统、人才培养体系和梯队建设。科室重视骨干师资的培养，依托医院的百人计划和全员培训计划，轮流安排优秀人才出国进修培训学习，同时安排青年骨干与国内大型医疗机构的普通外科进行学术交流。科室具有优良的师资队伍，目前拥有教授29人，副教授30人，主治医师41人。普通外科专业是北京协和医学院的博士和硕士培养点，目前有博士生导师19名，硕士生导师26名。历年承担八年制医大本科生、住院医生、研究生和进修生的教学工作，屡获北京市及院校级教学荣誉。科室完善教学相关规定和制度的建立，加强教学人员的配置和教学活动的管理，开展众多品牌教学活动：教学查房、病房小讲课、疑难病例讨论、三生讲课、英文病例讨论、模拟培训等，使教学对象获得丰富的学习体验，取得良好的教学效果。科室教学骨干积极开展教学科研工作，先后有多人次承担院校级教学科研项目10余项，发表中英文教学文章20余篇。在继续教育方面，科室连续十余年举办“北京协和医院普通外科微创技术论坛”，成为科室的品牌学术活动。

基本外科重视临床和基础科研，基本外科实验室最早是由曾宪九教授于上世纪50年代开设的营养代谢实验室。经过数十年的发展，基本外科科研实力日益增长。实验室拥有大批先进设备，能满足从动物实验到分子生物学等各层次研究的开展需求。近年来每年均获得多项国家自然科学基金课题及其他省部级以上课题，累计科研课题经费逐年攀升达数千万，近5年共发表SCI论文362篇，累计影响因子超过1500分，最高影响因子44.002分。在临床研究方面也取得重要突破，成果发表在Lancet Oncology、Annals of Surgery等国际顶级期刊。科研成果先后4次获国家科技进步二等奖，科室连续3年在中国医院科技量值（STEM）排行榜位列专科第二名。