1921年7月，中国共产党在上海召开第一次全国代表大会，宣告了中国共产党的正式成立。1921年9月，北京协和医院举行开幕典礼，一所高水平的现代西医医院在北京诞生。协和与党同龄，与祖国同命运。历经百年沧桑，正是在党的坚强领导下，协和才能在饱经风霜后翻开新的历史篇章，踏上新时代的征程。

1948年起，为和平解放北平，多名地下党员通过各种渠道秘密进入北京协和医院，先后成立“协新社”和“唯物社”等党的外围组织，积极宣传党的政策，为保全医院师资、财产和设备作出了贡献。1949年8月，协和地下党组织向群众公开，先期成立了职工支部、学生支部两个党支部，共计26名党员。协和团支部于1949年10月成立。

1951年，中央人民政府接管“私立北平协和医学院”和“北平协和医院”，开启了协和在党的领导下，由中国人自行管理和建设的历程。协和人以极大的爱国热情投身社会主义建设，为新中国的医学研究、疾病防治、学科筹建、人才培养及主要医疗机构的建立作出了历史性的贡献。

1953年，中国人民解放军总后方勤务部卫生部直属中国共产党委员会，批准中共北京协和医院委员会成立，并任命罗诚为首任党委书记。在卫生部的批复文件中这样写道：“现已经党委研究批准：由该院政治委员罗诚同志为党委书记，以丁志辉、樊迪虹、朱朝成、杨忠孝四同志为委员。特此批复。”该批示的原件现存放于协和医院的院史馆中。

中国人民解放军总后方勤务部卫生部关于中国协和医院党委成立、党委委员及党委书记任命的批复

在医院党委的领导下，基层党建工作不断加强，协和知识分子的思想达到新境界。1955年前后，十几名高级知识分子加入中国共产党，其中包括冯传宜、胡懋华、张茞芬、张锡钧、邓家栋、许英魁等一大批赫赫有名的协和名医。为了支援全国各地医疗卫生事业发展，协和将培养和积蓄的大批医学人才输送到全国各地，也把协和的传统、作风、教育与科学理念、组织体制和管理经验带到了全国。

与此同时，由于高级人才的流失，教学特色和传统优势未得到保留，协和医院的医疗水平出现下滑。1957年，张孝骞本着对中国医学教育的历史责任感，抱着巨大的政治勇气，上书中央建议恢复协和医学院，同年被国务院批准。1959年，周恩来总理亲自为学校定名为“中国医科大学”。中央指示，“只要有党的领导，可按照老协和医学院的办法办”，该方针后来被简化为“党的领导加旧协和”。

60年代初，在中央“调整、巩固、充实、提高”八字方针的指引下，医院经过调查研究，首先恢复老协和的教育体制和传统，并完善科室设置，健全指挥系统，恢复各项制度，通过全面治理整顿，医疗质量显著提高，老协和优良传统得以逐步恢复。然而，协和为恢复传统所做的努力在文革期间受到了极大冲击。

首都医院党委会恢复后召开第一次党员大会

1971年起，医院工作出现转机，党员重新登记、恢复组织生活，专家们逐步回到工作岗位。1972年底，医院由连队建制改回科室制。1973年，最后一届军管会撤走，医院恢复了学术委员会，恢复了住院病历书写、查房、会诊、交接班等制度，建立了慢性气管炎防治组、抗癌组、计划生育组、针刺麻醉组和地段保健组等，将医大毕业的各届学生约180名招回医院进修，为改革开放后恢复研究生招生工作、缓解人才断档打下基础。

党的十一届三中全会提出了尊重知识、尊重人才的重要方针，医院在拨乱反正、恢复调整的基础上，全面落实党的知识分子政策，焕发出盎然的生机。医务人员解脱了沉重的历史政治包袱，精神大振，干劲激增。

医院党委努力解决长期以来知识分子入党难问题。1980年至1989年期间，张孝骞、冯应琨、池芝盛、罗慰慈、张振寰、唐伟松、李向东等40余名高级知识分子光荣地加入了中国共产党。1985年11月26日，刚做完肺癌手术出院仅两个多月，88岁高龄的张孝骞带着他的“入党申请书”亲自找到院党委书记王荣金，表达了希望在耄耋之年入党的诚挚愿望。12月18日，内科党总支胃肠、血液组党支部举行党员大会，讨论张孝骞入党问题。介绍人王荣金、陈敏章介绍了张孝骞的情况，支部大会通过了他的申请。12月28日，协和医院党委审议了所在党支部的决议，吸收张孝骞为中国共产党党员。在鲜红的党旗下，张孝骞一字一句宣读着入党誓词。“通过新中国成立前后的对比和我自己的亲身经历，我深切地体会到，只有社会主义才能救中国，只有在中国共产党领导下，许多有志之士救国救民的理想才能实现……”88岁高龄的张孝骞终于实现了从一个热血青年到爱国主义者再到中国共产党党员的飞跃，他的经历正是中国一代高级知识分子追求真理、开拓进取、科学报国的共同命运的写照。

1985年，张孝骞在88岁高龄时加入中国共产党

十一届三中全会之后，全党的工作重点转移到了社会主义现代化建设上来。1983年，卫生部选择协和医院作为城市医药实体改革的第一块试验田，籍此推动整个卫生系统的改革。协和的实践为指导全国卫生系统改革的方向和思路提供了新的依据。在1991年全国首次进行的医院等级评审中，协和以最高分通过评审，成为首批三级甲等医院。

二十世纪90年代初，协和在全国率先开展医院文化建设。1991年，在协和建院70周年之际，医院召开协和精神研讨会，确定“严谨、求精、勤奋、奉献”为协和精神的表述。2011年总结凝练出“病人满意、员工幸福”的办院理念。2016年又新提炼出了“学术协和、品质协和、人文协和”为表述的协和百年内涵。医院在总结既往办院经验的基础上，用“以人民为中心，一切为了患者”的办院方向指导管理实践，积极推进现代医院管理模式创新，医院的新思路、新举措得到普遍认同。

党的十八大、十九大以来，医院党委按照进一步加强公立医院党的建设的总要求，一抓思想引领，注重文化建设，二抓制度创新，培育优良作风，三抓办院方向，坚持患者至上，全院员工大力弘扬社会主义核心价值观，把服务人民健康的理念融入为患者服务的实际工作中，精神文明和文化建设成果丰硕，人民群众的获得感和满意度不断提高。

2019年是中华人民共和国成立70周年。回首70年，中国从积贫积弱到民主富强，走出了一条世界瞩目的中国道路。展望未来，700余天后协和人将迎来建院百年的历史时刻。全体协和人正以前所未有的凝聚力、强大无比的使命感、中流击楫的坚定决心，向着新百年发起冲刺。以“一切为民”思想为宗旨，以“六大体系”建设为抓手，协和决心在新时代持续领先、扩大领跑优势，为推进健康中国建设，实现人民健康作出新的更大贡献。

2009年，医院举办“已故知名老专家、老院领导事迹展览”